Els frescos que es troben a la cúpula. transsepte i nau central de l’església són obra del frare cartoixà Manuel Bayeu (Saragossa. 1740 –  1815). cunyat de Goya. i daten de l’any 1807. Hi apareixen escenes de l’Antic i el Nou Testament: el Naixement i la Presentació de la Verge. els Desposoris. el Trànsit. l’Assumpció. la Trinitat a la Glòria. diferents al·legories. les Maries davant del Sepulcre. i el sopar d’Emmaús. Són remarcables les figures que es troben a les petxines de la cúpula central. dedicades a la representació de grans heroïnes de l’Antic Testament: Judith. Esther. Dèbora i Jael; quatre de les denominades vuit dones fortes de la Bíblia. En quant a la tècnica. la pintura al fresc és un procediment pictòric molt exigent. realitzat en parets i sòtils amb colors dissolts en aigua i cal. estesos sobre una capa d’estuc fresc. que demana rapidesa d’execució i gran habilitat a l’autor.